ביוכימיה/אפיון השייר הצדדי של החומצות האמיניות השונות

חומצות אמינו הידרופוביות

חומצה אמינית הידרופובית, כמו כל מולקולה הידרופובית לא מסיסה במים, כלומר, אינה יוצרת קשר כימי עם המים). הקשר הכימי הקיים הוא קשר ו.ד.ו, הנוצר בין מולקולות פוביות שונות.
כאשר בחלבון, יש חומצה הידרופובית בשייר R, הוא ממוקם בחלק פנימי של החלבון; באיזור בו אין מגע עם מים.
בחלבונים הממוקמים בממברנה יש הרבה חומצות אמיניות פוביות כיוון שהממברנה הינה פובית.

בעלות NH2 ו-COOH

• 
  אלנין (Ala)-מולקולה קטנה והירופובית.
• 
  ולין (Val)
• 
  לאוצין (Leu) - שלד פחמימני ארוך.
• 
  איזולאוצין (Ile) - שלד פחמימני.
• 
  פנילאלנין (Pיק)- מכילה טבעת בנזן.
• טריפטון (Trp)-מכיך טבעת בנזן
  טריפטון (Trp)-מכיך טבעת בנזן
• 
  פרולין (Pro)-יחודית במבנה שלה ולכן משפיעה על מבנה החלבון.
• 
  מתיונין (Met) - מכילה אטום גופרית (S).

חומצות אמינו נטרליות / קוטביות הידרופיליות

חומצות הידרופוליות מסיסות במים, אשר אינן מתיינות ב-pH פזיולוגי, יוצרות קשר מימן עם המים. במילים אחרות, "קוטביות נטרליות". בעלות שלוש תכונות :

1. נטרליות.
2. בעלות קשר מימן.
3. בעלות O ובעלות H

• 
  גליצין (Gly) - החומצה האמינית הקטנה ביותר; בקבוצת השייר שלה יש מימן.
• 
  סרין (Ser) - מכילה בקבוצת השייר שלה OH.
• 
  טירוזין (Tyr) - - מכילה בקבוצת השייר שלה OH.
• 
  תראונין (Thr) - מכילה בקבוצת השייר שלה OH.
• 
  אספרגין (Asn) - מכילה קבוצת $N{h}_2$ שאינה מתיינת (לא יכולה לקבל מימן ולהפוך ל-$N{H}_3^{+}$, אך יוצרת קשר מימן.
• 
  גלוטמין (Gln) - מכילה קבוצת $N{h}_2$ שאינה מתיינת (לא יכולה לקבל מימן ולהפוך ל-$N{H}_3^{+}$, אך יוצרת קשר מימן.

חומצות אמינו טעונות חיובית

מטען חומצות האמינו ב-pH :

• ב-pH נמוך השייר טעון חיובית.
• ב-pH גבוהה יש מעט יוני $H_3$ בתמיסה ולכן, החומצה האמינית נטרלית.

החומצות האמיניות יוצרות קשר אלקרוסטטי ומימן.

• 
  ארגינין (Arg) - בעלת קבוצת $N{H}_3^{+}$ בשיר הצדדי וטעונות ב-pH פזיולוגי.
• 
  ליזין (Lys) - בעלת קבוצת $N{H}_3^{+}$ בשיר הצדדי וטעונות ב-pH פזיולוגי
• 
  היסטדין (His) - חומצה אמינית חלשה ולכן, ב-pH פיזיולוגי מחצית טעונה ומחצית לא.

חומצות אמינו טעונות שלילית

חומצות אמינו הנושאות קבוצת $CO{O}^{-}$ שיכולה לקבל מימן ולאבד את המטען ($COOH$). ב-pH הפיזיולוגי הן טעונות שלילית.

• 
  חומצה אספרקטית (Asp) - בעלת קבוצה קרבוקליות.
• 
  חומצה גלוטמית (Glu) - בעלת קבוצה קרבוקליות.

סיכום

חומצות אמינו הידרופיליות	חומצות אמינו הידרופוביות	חומצות אמינו טעונות חיובית (ל-א-ה)	חומצות אמינו טעונות שלילית
גלוטמין (Gln)	פנילאלנין (Phe)	ליזין(Lys)	חומצה אספרטית (Asp)
ציסטאין (Cys)	טריפטופן (Trp)	היסטדין (His)	חומצה גלוטמית (Glu)
סרין (Ser)	ולין (Val)	ארגנין (Arg)
אספרגין ( Asn)	מתיונין (Met)
תריאונין (Thr)	פרולין (Pro)
גליצין (Gly)	לאוצין (Leu)
טרוזין (Tyr)	אלנין (Ala)
	איזולאוצין (Ile)

• חומצות אמינו בעלות טבעת בנזן - טריפטופן (Trp), פנילאלנין (Phe), אלנין.
• חומצות אמינו בעלות שייר אליפסי (שרשרת פחמנית) - אלנין (Ala), לאוצין (Leu), פרולין (Pro), מתיונין (Met), איזולאוצין (Ile), | ולין (Val)
• חומצות אמינו מכילות גופרית (S) - ציסטאין, מתיונין.
• חומצות אמינו ארומטיות – לפירוט על התכונה לחץ כאן. החומצות : טירוזין, טריפטופן, פנילאלנין

• בבגרות מופיעה טבלת חומצות האמינו הבאה : טבלת חומצות אמינו.